Net zoals bij voedselgewassen, proberen telers hun gewassen zo weerbaar mogelijk te maken, onder andere door sterke rassen en betere bodemkwaliteit. Lelies zijn, net als andere gewassen, gevoelig voor schimmels, insecten, bacteriën, virussen en aaltjes. Volledig zonder middelen telen is op dit moment in de praktijk niet altijd mogelijk zonder grote risico’s voor de oogst. Daarom wordt gewerkt aan weerbare en robuuste bollen, verdere vermindering van de inzet van gewasbeschermingsmiddelen en groene alternatieven.